中国科学家发布SpyCLIP：共价连接技术开启CLIP高通量高精度新时代
你是否好奇，科学家如何更精准地捕捉细胞内的生命对话？最新突破来了！（观察者网讯）据观察者网3月5日从中科院网站获悉，1月31日，国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚实验室的重磅成果：SpyCLIP——一个易于使用且兼容高通量的CLIP平台，能以高精度表征蛋白质-RNA相互作用。该研究将SpyTag-SpyCatcher共价交联系统创新融入CLIP技术，大幅降低操作难度，同时显著提升数据特异性。团队还对CLIP建库流程进行重新设计，使其完美适配自动化与高通量应用需求。
SpyCLIP为解码细胞内蛋白质-RNA相互作用提供了更简便、更精准的利器。
目前，已知RNA结合蛋白已超千种，越来越多蛋白质被揭示具有RNA结合能力，这些RNA在调控蛋白质功能中至关重要。CLIP是研究体内蛋白质-RNA相互作用的核心技术，但现有方法依赖高特异性抗体，步骤繁琐，常需放射性标记，数据可重复性低，难以规模化。开发简洁高效、适合高通量的新方法成为领域关键挑战。
该研究采用基于SpyTag-SpyCatcher的共价交联纯化策略，极大提升了蛋白质-RNA复合物纯度。同时，团队创新设计CLIP建库流程，规避了传统方法中限制规模化和损耗样本的效率瓶颈，并引入通用input文库进行背景扣除，进一步增强了方法特异性。这些核心改进不仅摆脱了对抗体的依赖，还提高了数据信噪比和可重复性，大幅降低操作难度与时间，使SpyCLIP轻松应对高通量研究。借助这一新工具，团队在多种研究场景中展现了其强大威力：在哺乳动物细胞中，精准捕获PTBP1和RBFOX2的剪接调控位点；高特异识别SLBP与组蛋白mRNA的相互作用，并发现新结合对象；系统解析AGO2蛋白，揭示microRNA靶位点特征。SpyCLIP对多类RNA结合蛋白均表现出卓越灵敏度与特异性，为规模化、系统性研究蛋白质-RNA交互提供了简洁而精准的新方案。
吴立刚为论文通讯作者，副研究员赵雅和博士研究生张尧为共同第一作者。该研究获中科院、基金委和科技部支持。这一突破将加速生命科学探索，立即分享，共同关注前沿科技进展！
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